Muutke küpsiste eelistusi

E-raamat: Supercomputing for Molecular Dynamics Simulations: Handling Multi-Trillion Particles in Nanofluidics

3.00/5 (2 hinnangut Goodreads-ist)
, , ,
Teised raamatud teemal:
  • Formaat - PDF+DRM
  • Hind: 55,56 €*
  • * hind on lõplik, st. muud allahindlused enam ei rakendu
  • Lisa ostukorvi
  • Lisa soovinimekirja
  • See e-raamat on mõeldud ainult isiklikuks kasutamiseks. E-raamatuid ei saa tagastada.
Supercomputing for Molecular Dynamics Simulations: Handling Multi-Trillion Particles in NanofluidicsSuurem pilt
Teised raamatud teemal:

DRM piirangud

  • Kopeerimine (copy/paste):

    ei ole lubatud

  • Printimine:

    ei ole lubatud

  • Kasutamine:

    Digitaalõiguste kaitse (DRM)
    Kirjastus on väljastanud selle e-raamatu krüpteeritud kujul, mis tähendab, et selle lugemiseks peate installeerima spetsiaalse tarkvara. Samuti peate looma endale  Adobe ID Rohkem infot siin. E-raamatut saab lugeda 1 kasutaja ning alla laadida kuni 6'de seadmesse (kõik autoriseeritud sama Adobe ID-ga).

    Vajalik tarkvara
    Mobiilsetes seadmetes (telefon või tahvelarvuti) lugemiseks peate installeerima selle tasuta rakenduse: PocketBook Reader (iOS / Android)

    PC või Mac seadmes lugemiseks peate installima Adobe Digital Editionsi (Seeon tasuta rakendus spetsiaalselt e-raamatute lugemiseks. Seda ei tohi segamini ajada Adober Reader'iga, mis tõenäoliselt on juba teie arvutisse installeeritud )

    Seda e-raamatut ei saa lugeda Amazon Kindle's. 

This work presents modern implementations of relevant molecular dynamics algorithms using ls1 mardyn, a simulation program for engineering applications. The text focuses strictly on HPC-related aspects, covering implementation on HPC architectures, taking Intel Xeon and Intel Xeon Phi clusters as representatives of current platforms. The work describes distributed and shared-memory parallelization on these platforms, including load balancing, with a particular focus on the efficient implementation of the compute kernels. The text also discusses the software-architecture of the resulting code.
1 Introduction
1(10)
1.1 The Art of Molecular Modeling and Simulation
3(3)
1.2 Focus and Structure of This Work
6(5)
References
8(3)
2 Molecular Dynamics Simulation
11(20)
2.1 Molecular Models and Potentials
11(6)
2.2 Statistical Ensembles
17(1)
2.3 Algorithms for Nearest-Neighbor Search
18(3)
2.4 Characteristics of Large-Scale Molecular Dynamics Simulation of Fluids
21(2)
2.5 Simulation Code Mardyn
23(8)
References
27(4)
3 Parallelization of MD Algorithms and Load Balancing
31(14)
3.1 Target Systems
32(5)
3.2 Shared-Memory Parallelization
37(3)
3.3 Spatial Domain Decomposition
40(1)
3.4 Load Balancing Based on KD-Trees
41(4)
References
43(2)
4 Efficient Implementation of the Force Calculation in MD Simulations
45(14)
4.1 Memory Access Optimizations
46(2)
4.2 Vectorization
48(6)
4.3 Optimization Possibilities for Monatomic Fluids
54(5)
References
57(2)
5 Experiments
59(16)
5.1 Performance on SuperMUC
60(7)
5.2 Performance on the Intel Xeon Phi Coprocessor
67(3)
5.3 Multi-Trillion Particle Simulations
70(2)
5.4 Summary
72(3)
References
73(2)
6 Conclusion
75
Lisainfo e-raamatute kohta Lisainfo e-raamatute kohta
Püsilink: https://www.kriso.ee/db/97833191714872e.html
Märksõnad: